और विजेता है…

नवंबर 2017 में हमने जेनकोक्स के पीछे की तकनीक - लो-पास सीक्वेंसिंग के अभिनव उपयोगों पर एक शोध परियोजना को फंड करने के लिए एक जीनोमिक्स चुनौती की घोषणा की। हमें मिली जबरदस्त प्रतिक्रिया और हमारे द्वारा भेजी गई परियोजनाओं की विविधता से हम बहुत उत्साहित थे। घंटों की बहस के बाद आंतरिक समिति ने निर्णय लिया कि निर्णय बहुत कठिन था। बस कई दिलचस्प प्रस्ताव थे! अंत में, हमने दो विजेताओं का चयन किया: बनारस हिंदू विश्वविद्यालय से ज्ञानेश्वरी चौबे, ब्रिटेन के ऑक्सफोर्ड विश्वविद्यालय से भारत और क्रिस्टियन कैपेली।

ज्ञानेश्वरी चौबे, गेनकोव के साथ मिलकर भारतीय पारसी अल्पसंख्यक के जीनोम का नेतृत्व करेंगे। उन्हें संदेह है कि 57K पारसी आबादी एंडोगैमी के रिवाज के कारण बहुत समरूप है, जो सीमित संख्या में संस्थापकों का सुझाव देती है। ज्ञानेश्वर न केवल अलग पारसी संस्थापकों (जीनोमिक इतिहास, प्रवेश पैटर्न) का वर्णन करने में रुचि रखते हैं, बल्कि वे पारसियों के बीच प्रचलित सामान्य बीमारियों के लिए एक आनुवंशिक स्क्रीनिंग पैनल भी डिजाइन करना चाहते हैं। कई सौ व्यक्तियों की गेनोव के कम-पास अनुक्रमण से सामान्य आनुवंशिक वेरिएंट की पहचान हो सकेगी, जो एक व्यापक पारसी फेनोटाइप डेटाबेस के साथ जुड़ा हो सकता है।

ज्ञानेश्‍वर चौबे डीएनए सैंपल की प्रोसेसिंग करते हैं

क्रिस्टियन कैपेली समझना चाहते हैं कि मानव लार माइक्रोबायोम अंतरिक्ष, संस्कृति और मेजबान के आनुवंशिक मेकअप में कैसे बदलता है। आहार और पर्यावरण की भूमिका की जांच करने के लिए क्रिस्टियन, गेनकोव के साथ मिलकर दक्षिणी अफ्रीकी आबादी से संबंधित व्यक्तियों की लार से डीएनए अनुक्रमित करेंगे। वे सभी एक सामान्य आनुवंशिक पृष्ठभूमि साझा करते हैं, लेकिन अलग-अलग निर्वाह रणनीतियों (कृषिविज्ञानी या देहाती) हैं या विभिन्न क्षेत्रों (नामीबिया और लेसोथो) में दो अलग-अलग पारिस्थितिक क्षेत्रों, हाइलैंड्स और तराई क्षेत्रों में रहते हैं। अलग-अलग आहारों की खोज करने वाले भौगोलिक करीबी समूहों में आंत माइक्रोबायोम को अलग-अलग दिखाया गया है। क्रिस्टियन परीक्षण करेंगे कि क्या लार माइक्रोबियल समुदाय आहार में भिन्नता से प्रभावित हैं। पूरे जीनोम अनुक्रम डेटा का उपयोग, दोनों माइक्रोबियल टैक्सोनोमिक संरचना और उनके चयापचय प्रोफाइल में समूहों के बीच समानता और अंतर की तुलना करने का अवसर प्रदान करेगा।

क्रिस्टियन कैपेली और उनके समूह ने नामीबिया में नमूने एकत्र किए

दोनों परियोजनाएं गेनकोव की कम-पास अनुक्रमण तकनीक की अनूठी विशेषताओं का लाभ उठाती हैं - पारसी आबादी में नए वेरिएंट की खोज करने की क्षमता और अनुक्रमण की उपस्थिति दक्षिणी अफ्रीकी परियोजना के लिए मुंह माइक्रोबायोम से पढ़ती है।

कहने की सुई, दोनों शोधकर्ता वैज्ञानिक समुदाय को अपना डेटा उपलब्ध कराएंगे।

हमारे लिए कुछ और शानदार प्रोजेक्ट भेजे गए थे। कई शोध एक बीमारी के आनुवंशिकी का अध्ययन करने के लिए कम-पास अनुक्रमण का उपयोग करना चाहते थे और मुंह माइक्रोबायोम, माइटोकॉन्ड्रिया, जीनोम और पर्यावरण के बीच संबंध की खोज के बारे में हमारे पास कई प्रस्तुतियाँ थीं। भविष्य के नैदानिक ​​अनुप्रयोगों के साथ समझने वाली आबादी के जीनोमिक्स का अध्ययन करने पर केंद्रित कई परियोजनाएं भी थीं। एक प्रस्तुतिकरण ने ट्यूमर में प्रतिलिपि संख्या भिन्नता का आकलन करने के लिए कम-पास अनुक्रमण का उपयोग करने का सुझाव दिया। गैर-मानव अध्ययनों के लिए, जैव ईंधन उत्पादन के लिए इष्टतम खमीर उपभेदों की पहचान करना हमारा पूर्ण पसंदीदा था।

इस प्रकार के अनुसंधान की सुविधा प्रदान करना ठीक उसी प्रकार है जैसे हमने Gencove की शुरुआत की!

किसी भी रास्ते के रूप में वहाँ भी प्रस्तुतियाँ थीं जो सीधे विज्ञान-फाई थीं लेकिन हम आपको कल्पना पर बधाई देते हैं! कुछ विवरणों को टालने के बाद, उनमें से कुछ हमारी अगली चुनौती को फिर से प्रस्तुत करने के योग्य हो सकते हैं।